Dokładna data urodzenia Samuela Aleksandra Komarowskiego nie jest znana, pochodził z litewskiej szlachty i miał herb Dolenga. Najprawdopodobniej młody człowiek otrzymał dobre wykształcenie, ponieważ po raz pierwszy wspomniany w dokumentach jako rotmistrz chorągwi husarskiej w wojnie smoleńskiej między Rzeczypospolitej a Królestwem Moskiewskim w latach 1632-1634, jest to dobre poważne stanowisko.
W tej wojnie Smolenskiej Komarowski wyróżnił się w 1633 roku, kiedy na czele swojej chorągwi wtargnął do obozu moskiewskiego wojewoda Michaila Szejna, zabił i wziął do niewoli znaczną liczbę wrogów, zajął konie i zapasy. Ponadto uczestniczył w oblężeniu Białej, najazdem dotarł do Rzewa i Toropca. Za te Zasługi otrzymał w posiadanie wieś w województwie nowogródzkim. Po wojnie smoleńskiej został mianowany podczaszym Wilkomirskim, następnie Podstolim Wilkomirskim i instigatorem Litewskim (odpowiednik współczesnego stanowiska głównego prokuratora kraju).
Podczas wybuchu powstania Bohdana Chmielnickiego, Komarowski ponownie walczy jako rotmistrz chorągwi kozackiej w wojsku Koronnym Polski. W maju 1648 roku uczestniczył w bitwie pod Korsunem przeciwko wojskom kazacko-Krymskim, a jesienią tego samego roku na czele chorągwi dragunów walczył z Kozakami na Wołyniu.
Po powrocie na Litwę Aleksander Komarowski został mianowany pułkownikiem w wojskie Janusza Radziwilla, pod którego dowództwem zajął Pińsk. Następnie ponownie wyróżnił się w bitwie pod Lojewem w 1649 roku: w decydującym momencie wraz z rotmistrzem Adamem Pawłowiczem-Lukjanskim prawidłowo ocenił sytuację wojskową i uderzył w tył wojska kozackiego, zapewniając tym samym zwycięstwo.
W przededniu wojny królestwa Moskiewskiego I Rzeczypospolitej od 1654 do 1667 roku, Samuel Komarowski został mianowany oboźny Wielkiego Księstwa Litewskiego. Do jego obowiązków należało poszukiwanie miejsc pod obóz wojskowy i stacjonowanie wojsk. W 1655 roku Komarowski na czele trzytysięcznego korpusu bezskutecznie próbował wyzwolić Witebsk z moskiewskiego garnizonu.
Podczas podpisywania Unii Keidanskiej występował po stronie Janusza Radziwila i wspierał go, ale po śmierci Radziwila, pełniąc obowiązki namiestnika Wielkiego getmana Litewskiego, rozpoczął działania bojowe przeciwko Szwedom w Żemojtii. Tam na czele głównej części oddziału Korwin-Gosiewskiego walczył przeciwko szwedzkiemu generałowi Roberdowi Douglasowi.
Trudno było walczyć na dwóch frontach, więc zostawiając Szwedów, Komarowski przeszedł na wojnę z Królestwem Moskiewskim i rozwinął cały ruch partyzancki na Witebsku. W 1658 roku, w celu wyzwolenia miejscowości Głębokie od wojsk moskiewskich, łączy się z Mikołajem Wolowiczem, przywódcą trzech tysięcy chłopów uzbrojonych w Kosy i berdysze.
W maju 1659 roku Samuel Komarowski obległ armię moskiewską w Żemajtii i zmusił wojewoda Nashchekina do podpisania trzymiesięcznego rozejmu. Następnie, latem tego samego roku, odniósł szereg zwycięstw w potyczkach ze Szwedami. We wrześniu, na czele dywizji, wraz z oddziałem Polubińskiego, zmusił do poddania się Szwedzki garnizon w Goldingen (obecnie Kuldiga, Łotwa), a także do kapitulacji twierdzy Skrunda (dziś Skrunda, Łotwa). Następnie zajął portowe miasto Vindavy (dziś Ventspils, Łotwa).
Samuel Alexander Komarovsky nieustraszenie walczył o swoją ojczyznę i logiczne byłoby, gdyby taki wojownik zginął w bitwie, ale wszystko potoczyło się inaczej. W 1659 roku zmarł w wyniku wypadku na zamku w Grobin, gdzie został zaproszony przez Bogusława Radziwiła wraz z Aleksandrem Półbińskim na rozmowę. Według jednej wersji przyczyną śmierci było to, że nie obliczył możliwości swojego organizmu w burzliwej uczcie zorganizowanej przez Radziwiłła. Według innej wersji Komarowski zginął podczas spaceru po uczcie z powodu szalika na szyi, który zaplątał się w koło jadącej bryczki i udusił jego. Po śmierci jego zasługi wojenne dla ojczyzny zostały odnotowane w aktach konstytucyjnych z 1662 i 1677 roku.